质粒电泳条件
质粒电泳条件
影响电泳淌度的因素有哪些?
质粒的四种形式?
dna的分子特征和电泳条件。
(1) dna分子大小dna分子越大,在凝胶中的摩擦阻力越大,游动越慢,迁移率与线性dna分子量的对数值成反比。
Even如果dna分子的构型对于质粒DNA分子来说具有相同的分子量,不同的构型也会引起不同的电泳阻力,并最终导致不同的游泳速度。在常规电泳中,质粒dna分子在三种构型下的迁移速率为:超螺旋分子最快,线性分子次之,开环分子最慢。
⑵不同凝胶浓度对于同一dna分子,凝胶浓度越高,电泳速度越慢。不同凝胶浓度与dna片段的线性关系不同。浓度越稀的凝胶线性范围越宽,而浓度越稠的凝胶与小分子dna片段的线性关系越好。所以在常规实验中,高浓度凝胶分离(有时甚至2%凝胶)用于dna小片段的分离,低浓度凝胶用于大片段的分离。
⑶电场强度
Ethidium溴(简称eb),电泳中的染色剂,具有水平组织,可以嵌在dna碱基对之间。对线性分子和开环分子影响不大,对超螺旋分子影响较大。当嵌入dna分子中的eb分子数量逐渐增多时,原来的负超螺旋分子开始转变为共价闭环,电泳迁移速度由快变慢;当嵌入的eb分子进一步增加时,dna分子由共价闭环变为正超螺旋状态,电泳迁移速率由慢变快。游离eb在这个临界点的质量浓度为0.1g/ml~0.5g/ml,即电泳时加入的浓度。所以一般电泳可以忽略这个因素,但对于特殊电泳,可以采用电泳后染色来消除这个因素的影响。
[6]电泳缓冲液
质粒的四种形式?
形态上基本可以分为三类:超螺旋、线形、开环。由于形态不同,在不同的电泳条件下,电泳速度会有所不同。而质粒复制没有明确的规律,可能处于各个复制阶段,所以电泳检测时提取的质粒可能超过或少于三条带是正常的。
电泳,为什么超螺旋DNA移动最快?
DNA的分子特征和电泳条件。(1) DNA分子大小DNA分子越大,在凝胶中的摩擦阻力越大,游动越慢,迁移率与线性DNA分子量的对数值成反比。Even如果DNA分子的构型对于质粒DNA分子来说具有相同的分子量,不同的构型也会引起不同的电泳阻力,并最终导致不同的游泳速度。在常规电泳中,质粒DNA分子在三种构型下的迁移速率为:超螺旋分子最快,线性分子次之,开环分子最慢。⑵不同凝胶浓度对于同一DNA分子,凝胶浓度越高,电泳速度越慢。不同凝胶浓度与DNA片段的线性关系不同。浓度越稀的凝胶线性范围越宽,而浓度越稠的凝胶与小分子DNA片段的线性关系越好。所以在常规实验中,高浓度凝胶分离(有时甚至2%凝胶)用于DNA小片段的分离,低浓度凝胶用于大片段的分离。Electric场强⑷溴化乙锭简称EB。电泳中的染色剂,具有水平组织,可以嵌在DNA碱基对之间,对线性分子和开环分子影响较小,对超螺旋分子影响较大。当嵌入DNA分子中的EB分子数量逐渐增多时,原来的负超螺旋分子开始转变为共价闭环,电泳迁移速度由快变慢;当嵌入的EB分子进一步增加时,DNA分子由共价闭环变为正超螺旋状态,电泳迁移速率由慢变快。游离EB在这个临界点的质量浓度为0.1g/ml~0.5g/ml,即电泳时加入的浓度。所以一般电泳可以忽略这个因素,但对于特殊电泳,可以采用电泳后染色来消除这个因素的影响。[6]电泳缓冲液
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